电磁屏蔽机房通风设计是为屏蔽机房送入清洁的和经过调温的空气，以满足舒适和排除有害物的要求。而且，通风系统通常要比空调系统简单，而且空调系统在进出电磁屏蔽机房的时候还需要做相应的屏蔽处理，通风系统进出电磁屏蔽室的时候只需要风口和电磁屏蔽室的通风波导窗软性连接即可，切记不能在通风波导窗上面打螺丝固定，会破坏整个电磁屏蔽机房的屏蔽性能，通风波导窗常用的尺寸为300*300和300*600。所以在可能的情况下，尽量采用通风系统取代空调系统。
电磁屏蔽机房各部位需要的通风量一般按换气次数确定。要使通风系统充分发挥作用，主要的是气流分布的设计。按照送回风口位置的相互关系和气流方向，气流分布可采用以下形式：
(1)上送风上回风:当机房进深较小时，可采用单侧上送上回形式，送回风管叠置在一起，空气从上部送出，经工作区后回流向上进入回风管。如果机房进深较大，可采用双侧送回形式。
(2)上送风下回风:如果机房的下部方便设置回风口，可采用该形式，送风口设置在机房上部，回风口设置在机房下部，空气从上部送出，经工作区后空气进入回风管。
(3)中送风:对于一些机房空间较大，在其高度的中部送风，下部回风或下部回风加上部排风。
以上的气流分布形式均可以在工作区形成均匀的温度场和速度场，中送风还可产生显著的节能效果。
